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济南戴尔服务器代理商:戴尔XE8545服务器帮助企业轻松应对AI时代浪潮

来源:www.it778.com  |  发布时间:2022年05月31日

济南戴尔服务器代理商分享,戴尔XE8545服务器帮助企业轻松应对AI时代浪潮。戴尔科技中国研究院以及戴尔数据中心业务部解决方案团队,通过在GitHub下载AlphaFold2模型代码,部署在戴尔XE8545服务器上,使用NVIDIA A100 GPU测试AlphaFlod2对68-2750个氨基酸残基组成的不同大小的蛋白质进行3D结构预测,对AlphaFold2的计算性能和特性进行评估。


戴尔XE8545服务器


济南戴尔服务器代理商告诉我们,戴尔XE8545服务器是戴尔科技推出的15G服务器家族中,专门针对AI GPU计算进行设计和优化的加速服务器。4U空间内可以支持4张A100 GPU加速卡,GPU之间通过NVLink实现600GB/s的pear-to-pear高速直连通信。

测试环境硬件及软件配置如下:

●AMD EPYC 7713 64-Core Processor × 2

●1024 GB memory

●Nvidia A100 GPUs × 4, 80GB/500W

●CentOS Linux 7.0

●Python 3.8.0, TensorFlow 2.5.0

●CUDA 11.5, cuDNN 8.3

戴尔XE8545服务器推理68-2750个氨基酸残基组成的蛋白质的3D结构预测耗费的计算时间如下表所示(Top 1模型,即推荐置信度模型),使用单张A100推理计算时间从19.3分钟到2个半小时不等。

通过性能日志分析,我们可以看到AlphaFold2在推理过程中,由CPU和GPU交替计算,第 一阶段同源序列搜索、模版搜索及特征构造,以及最 后阶段3D结构生成的计算过程主要由CPU计算;中间第二个阶段Evoformer神经网络和结构模块计算则主要由GPU进行计算。而戴尔XE8545服务器所提供的强劲GPU算力与AMD 多核CPU算力(128核),则能够确保AlphaFold2在规定时间内完成一个大型的蛋白质3D结构的预测计算。





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